金雕案开庭前，罗远(高伟光 饰)前往看守所与袁笑笑(张艺凡 饰)会面，了解她喜欢小动物的原因，以及救助金雕背后的故事。在法院外，罗远向声援抗议的人群分发金雕的资料，告知他们金雕被圈养买卖的风险，才是导致袁笑笑被判刑三年的真正原因。
罗远认为，如果人们真的爱护动物，应该通过网络普及知识，帮助野生动物回归自然栖息地，同时也是对袁笑笑最大的善意和支持。随后，他将资料交给林海岚(吕晓霖 饰)，承认三年刑期属于合理范围，两人终于冰释前嫌。
这天晚上，苏卓(代斯 饰)对袁笑笑等人有了改观，夏未冬(陈数 饰)也认真考虑罗远的话。袁笑笑的未来并非完全由判决决定，而是在她违法的那一刻起就已经受到影响，如果这个案子能促使其他人不再重蹈覆辙，那么判决就有了意义。夏未冬看出罗远心里难受，用他说过的话来安慰他。
随后金雕案在中级人民法院开庭审理，林海岚当庭宣布维持原判，袁笑笑和父母难受不已。另一方面，罗远对七星运盛化工厂进行了审判，因其非法处理污水业务，需承担百万元生态环境修复费用。同时，凤凰岭祥发集团和江石化工厂因生产废料管理不当，间接导致生态环境污染，需要承担五万余元的修复费用。
江石化工厂的几名主犯被公开审判，因犯非法储存危险物质罪、环境污染罪和单位行贿罪，判处罚金一千三百万元。原工厂总经理石磊(张怀公 饰)数罪并罚，被判处有期徒刑二十年，辛阳(林静 饰)因提供虚假证明文件罪获刑一年。这一判决发出，大快人心，莫海言带领一干领导召开发布会，着重强调保护生态环境的重要性。
尽管事情告一段落，罗远和耿念(袁文康 饰)仍心事重重，化工厂对生态环境的伤害最大，但赔偿最少、判刑最轻，而无辜的袁笑笑却要为此付出三年的青春，令他们难以接受。正因如此，罗远更加希望有环境法庭的存在，只有接触越来越多的环境案件，才能给后来人积累宝贵经验和完善的司法体系。
在丹顶鹤生态场，罗远遇到了当义工的夏未冬，得知他父亲曾为守护丹顶鹤而牺牲。夏未冬曾对大自然充满憎恶，但后来理解了父亲的爱，并改变了大学专业。罗远从她的讲述中，对她有了更深的认识。
随着环保庭在七星县人民法院的成立，罗远和耿念第一时间报到，并见到了院长刘文燕(方晓莉 饰)。只是罗远从未想过他们的办公室如此简陋，刘文燕解释院里办公室比较紧张，再加上环保试点赶得匆忙，一时半会找不到更好的办公室，委屈他们先对付下。
除了助理庞云(黄子琪 饰)和书记员聂闻(刘畅 饰)以外，林海岚也应邀加入，由罗远担任代理庭长。尽管办公室被安排在一间破旧的门房，大家仍是干劲十足，忙活一整天将房间收拾干净，集体拍了一张合影照。夏未冬和苏卓交流环保法庭，苏卓对此并不看好。
耿念下班后与妻子徐飞(郎月婷 饰)回家，母亲刘慧珊(穆丽燕 饰)得知儿子又被调回县里，儿媳妇还要考护士编制，心里颇为不悦。夫妻俩结婚十年还没有孩子，刘慧珊免不得抱怨一番，气氛显得格外压抑。而林海岚在疲惫地回家后，看到体贴的丈夫关逸(刘天佐 饰)，心情得到了缓解。
罗远邀请夏未冬共进晚餐，意外收到夏未冬送的花。夏未冬对饶斌(遇泓羊 饰)的离世始终难以释怀，罗远表示环保庭的意义在于避免类似事件再次发生。然而，环保庭在成立初期并未如预期般忙碌，一连多日都未能接到案件。
正当大家感到失望之际，刘文燕院长为他们送来了一份卷宗，可当他们看见内容与垃圾囤积的邻里纠纷有关，不免有些失落。尽管如此，耿念还是带着罗远前去处理，两人刚到现场就被一群人包围，住户们纷纷表达对郭水清(马仑 饰)夫妻俩的不满情绪，抱怨他们夫妻已经两个月没有出门，却不断地往楼道里丢弃垃圾，拒绝与邻居沟通。